Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms