Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC005176.1-203ENST00000597077 532 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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LINC00587B1AMM8 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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LINC00587B1AMM8 FAM74A6-203ENST00000615956 481 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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LINC00587B1AMM8 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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LINC00587B1AMM8 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
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