Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms