Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL034372.1-201ENST00000407586 754 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC008026.1-201ENST00000460492 447 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 PCNAP3-201ENST00000397222 778 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms