Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF2H3Q13889 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms