Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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