Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PICALMQ13492 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217 ms