Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms