Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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