Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms