Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms