Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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