Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 ALDOB-201ENST00000374855 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 EFCAB7-201ENST00000371088 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC127459.1-201ENST00000563129 2768 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC078795.1-201ENST00000602342 3143 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 LINC00663-203ENST00000586885 2546 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 OR4D6-201ENST00000300127 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 RN7SKP208-201ENST00000365474 361 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 SMCP-201ENST00000368765 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 RNU1-11P-201ENST00000383975 164 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AL356311.1-201ENST00000451697 258 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 DKK2-204ENST00000513208 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC116348.2-201ENST00000563751 577 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 DNM1P34-202ENST00000567850 315 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 USP32P1-202ENST00000393005 3846 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MSX1P28360 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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