Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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