Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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SGCZQ96LD1 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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