Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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CCDC93Q567U6 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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CCDC93Q567U6 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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