Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LINC02121-201ENST00000507950 432 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC023794.3-201ENST00000514503 564 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC008632.1-201ENST00000519400 753 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 WBP1LP10-201ENST00000519787 364 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 C1RL-211ENST00000545280 449 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02413-202ENST00000552353 898 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SL457P-201ENST00000578760 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC008474.1-201ENST00000589127 573 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TDGF1P7-201ENST00000593394 559 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP006545.2-201ENST00000607091 461 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC00635-221ENST00000609366 784 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CR786580.1-201ENST00000417843 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC01410-201ENST00000424345 2877 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL160408.1-201ENST00000417805 1373 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PPFIA2-204ENST00000541017 4192 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ANKRD39Q53RE8 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ANKRD39Q53RE8 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ANKRD39Q53RE8 KRTAP21-1-201ENST00000335093 599 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ANKRD39Q53RE8 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ANKRD39Q53RE8 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC009948.2-201ENST00000437039 713 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 Z93930.2-201ENST00000458080 505 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RN7SL757P-201ENST00000466709 301 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL590867.2-201ENST00000492974 447 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MBL1P-202ENST00000497731 758 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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