Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC079584.1-201ENST00000426716 464 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 IGHV3OR16-15-201ENST00000565463 414 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC024270.2-201ENST00000568441 499 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CADPS-220ENST00000613879 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR2G6-201ENST00000343414 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC099560.1-201ENST00000412811 500 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC008937.2-201ENST00000415589 619 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP001595.1-201ENST00000435878 516 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SEC22A-210ENST00000492595 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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