Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC006547.1-211ENST00000609191 828 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC134981.1-201ENST00000628076 348 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 KLF8-206ENST00000640927 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 STX18-AS1-206ENST00000608184 3047 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 DTNA-209ENST00000556414 1626 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC068512.1-201ENST00000584542 1811 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 FANK1-201ENST00000368689 522 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RPL12P27-201ENST00000414870 496 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AL049758.1-201ENST00000423154 397 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AP003774.3-201ENST00000457725 985 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PAQR9-AS1-202ENST00000493825 576 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 CC2D2A-205ENST00000503658 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PTK2-241ENST00000522950 548 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 DTNA-220ENST00000590831 847 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC239600.2-201ENST00000619615 1165 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms