Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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