Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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TOP3AQ13472 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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TOP3AQ13472 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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TOP3AQ13472 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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