Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TCOF1Q13428 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
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