Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MAPK10-333ENST00000641607 2481 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TRIM5-201ENST00000380027 2290 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TRIM49D1-201ENST00000420869 1651 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TRIM49D2-202ENST00000623787 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SLFN12-206ENST00000452764 2423 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ZNF268-206ENST00000536899 3236 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CXCR6-201ENST00000304552 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 APOL3-202ENST00000361710 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC100849.1-202ENST00000517949 562 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OR4N1P-201ENST00000554847 949 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MASP1-205ENST00000392472 3900 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MET-204ENST00000436117 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NFRKB-202ENST00000524746 4114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TRIM6-203ENST00000380107 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 GSTM2-204ENST00000369831 1730 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 GFRAL-201ENST00000340465 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AMPD3-202ENST00000396553 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC139256.1-201ENST00000569858 2598 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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