Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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TRAF1Q13077 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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TRAF1Q13077 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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TRAF1Q13077 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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