Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LMAN2Q12907 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LMAN2Q12907 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms