Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TWF1Q12792 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms