Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TTPAP49638 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TTPAP49638 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TTPAP49638 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
TTPAP49638 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TTPAP49638 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TTPAP49638 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TTPAP49638 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TTPAP49638 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TTPAP49638 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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TTPAP49638 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TTPAP49638 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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