Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL158151.2-201ENST00000434250 241 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ATP6V1G1P3-201ENST00000442568 280 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 APOA2-203ENST00000463812 401 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RN7SL700P-201ENST00000496982 294 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC084866.1-201ENST00000508955 554 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 CARMN-203ENST00000509909 592 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC024022.1-203ENST00000515392 478 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL662844.2-201ENST00000538455 284 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC084816.1-211ENST00000540994 485 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC002094.3-201ENST00000555059 851 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC005552.1-201ENST00000577556 662 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC005828.5-201ENST00000582741 355 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC073869.5-201ENST00000635979 465 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 HS6ST2-206ENST00000640529 831 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 USP11-201ENST00000218348 3338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 GREB1L-209ENST00000580732 8749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 IRF2-201ENST00000393593 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 JADE1-201ENST00000226319 5772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 CACNB4-209ENST00000534999 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ZWILCH-201ENST00000307897 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 BRD7-201ENST00000394688 5370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LINC00665-208ENST00000591372 2732 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MMP27-201ENST00000260229 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ELF5-202ENST00000312319 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PLA2G4C-201ENST00000354276 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC092999.1-201ENST00000624004 1924 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 KRT80-202ENST00000394815 3859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 KRT7-AS-201ENST00000546686 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPAP1-201ENST00000304330 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 CARD14-201ENST00000344227 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPL15-204ENST00000413699 2053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 OAS2-203ENST00000449768 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TSPYL4-201ENST00000420283 4180 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 FHL1-201ENST00000345434 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LY9-203ENST00000368037 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RAB7B-205ENST00000623893 1851 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NAPB-203ENST00000432543 3754 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TNFAIP3-201ENST00000237289 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MYL6BP1-201ENST00000429485 615 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 Z83841.1-201ENST00000433173 968 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MRPL21-202ENST00000450904 662 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL109809.2-201ENST00000455216 493 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL451124.1-201ENST00000478520 1026 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 IGKV1-12-201ENST00000480492 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 IGKV1-17-201ENST00000490686 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC233724.8-201ENST00000504574 234 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC233724.3-201ENST00000512613 128 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AP001189.4-201ENST00000533588 452 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC008013.3-201ENST00000605711 675 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.140-201ENST00000613842 252 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC138894.4-201ENST00000616703 256 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC145285.8-201ENST00000619561 255 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC073592.9-201ENST00000624885 371 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 IPO4-221ENST00000625289 297 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ITGA6-203ENST00000409532 3544 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC013444.1-201ENST00000428909 1904 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PAQR7-201ENST00000374296 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TTPA-201ENST00000260116 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LY6G5B-207ENST00000375864 2654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 BFAR-207ENST00000563971 1662 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TUT1-205ENST00000476907 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 HDC-201ENST00000267845 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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