Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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