Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms