Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms