Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP6Q3SY56 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms