Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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