Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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FXNQ16595 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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FXNQ16595 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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