Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms