Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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