Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RPSAP52-201ENST00000489520 1144 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PIGFP1-201ENST00000519180 653 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 IGHV7-40-201ENST00000520963 296 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 OPRK1-204ENST00000524278 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC022165.1-201ENST00000568771 596 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RIT2-202ENST00000589109 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 ZNF83-209ENST00000596930 560 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC084876.1-201ENST00000612793 641 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC143336.1-201ENST00000614164 836 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RN7SL301P-202ENST00000618767 298 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 OR9K2-204ENST00000641374 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 EYA4-213ENST00000531901 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TLR1Q15399 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TLR1Q15399 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TLR1Q15399 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TLR1Q15399 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TLR1Q15399 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AL355076.1-201ENST00000484315 270 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 NMNAT1P4-201ENST00000505598 840 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 TSPAN8-203ENST00000546561 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 IGHV1OR15-4-201ENST00000560037 348 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC010719.1-201ENST00000602992 747 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TLR1Q15399 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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