Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms