Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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