Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms