Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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