Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL1Q13616 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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