Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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CHAF1AQ13111 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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