Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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TRAF1Q13077 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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TRAF1Q13077 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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TRAF1Q13077 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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TRAF1Q13077 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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TRAF1Q13077 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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TRAF1Q13077 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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TRAF1Q13077 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TRAF1Q13077 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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