Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GPC5P78333 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPC5P78333 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPC5P78333 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.2 ms