Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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HOXD13P35453 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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HOXD13P35453 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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HOXD13P35453 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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HOXD13P35453 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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HOXD13P35453 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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HOXD13P35453 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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HOXD13P35453 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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HOXD13P35453 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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