Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NFKB1P19838 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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