Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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LRRTM2O43300 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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