Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 PAX6-282ENST00000640975 2553 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 IPO7P2-201ENST00000451446 1750 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 C10orf25-201ENST00000625168 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms