Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms